Postdoktorandin / Postdoktorand (d/w/m) Mikrobiom - Bioinformatik, Metagenomik und Metaproteomik

In diesem Projekt konzentrieren wir uns auf Mikrobiome im Allgemeinen und auf kommensale Hefen sowie auf chronisch-entzündliche Darmerkrankungen (CED). Mithilfe von Metagenomik und Metaproteomik wollen wir kommensale Pilze, wie beispielsweise den von der WHO priorisierten Krankheitserreger Candida albicans, identifizieren, das Immunsystem trainieren und den Krankheitsverlauf bei entzündlichen Erkrankungen zu beeinflussen.

Sie werden modernste computergestützte Verfahren entwickeln und anwenden:

Um das menschliche Mykobiom durch die Reanalyse metagenomischer Datensätze und die Verarbeitung klinischer Proben zu kartieren und so die Vielfalt der Hefespezies und -stämme zu identifizieren

Um Multi-Omics-Daten (Zusammensetzung von Myko- und Mikrobiom, Metaproteomik, Genomik, Immunphänotypen) zu integrieren und verbesserte Strategien zur Metaproteomik-Datenanalyse zu unterstützen

Um Prädiktoren zur Identifizierung wichtiger Pilz- und Wirtseigenschaften zu entwickeln, die die Resilienz bzw. Anfälligkeit gegenüber Entzündungen bestimmen

Um standardisierte Bioinformatik-Pipelines für die Pilzextraktion, Metaproteomik und Stammcharakterisierung zu etablieren und dabei mit Laborforschern, Immunologen und Klinikern zusammenzuarbeiten

Sie werden als wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter beschäftigt: Nach §110 (4) Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor