Bioinformatiker (m/w/d)

Beschäftigungsart:

Vollzeit

Arbeitszeit:

38,5 Stunden pro Woche

Befristung:

befristet bis 31.12.2029 - eine anschließende Übernahme ist angestrebt

Beginn zum:

nächstmöglichen Zeitpunkt

Vergütung:

bis zur Entgeltgruppe 13

Ihre Aufgaben

Mitarbeit im Modellvorhaben Genomsequenzierung in enger Zusammenarbeit mit klinischen und wissenschaftlichen Partnern

Schnittstellenfunktion zwischen Pathologie und Medizininformatik innerhalb der Universitätsmedizin, Teilnahme an Tumorboards

Eigenständige Analyse von Sequenzierungsdaten, insbesondere Genpanel, WES und WGS

Anpassung und Anwendung bioinformatischer Analysepipelines inklusive Unterstützung bei der Etablierung und Weiterentwicklung von Workflows für die genomische Diagnostik

Interpretation und Aufbereitung der Analyseergebnisse für die weitere Befunderstellung

Dokumentation der Analysen sowie Mitwirkung an Qualitätssicherungsmaßnahmen

Ihr Profil

Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in (Medizin-/Bio-) Informatik oder einem verwandten Fachgebiet

Fundierte Kenntnisse in der Analyse von NGS-Daten (RNA-Seq, WES, WGS, etc.)

Erfahrung im Umgang mit gängigen bioinformatischen Tools und Pipelines (z.B. sarek, strelka, cnvkit, DRAGEN) und Datenformaten (z.B. FASTQ, BAM, VCF)

Sehr gute Programmierkenntnisse (z.B. Python, R) sowie Erfahrung mit Linux-Umgebungen

Erfahrung mit Datenbanktechnologien sowie gängigen Datenintegrationswerkzeugen

Kenntnisse im Umgang mit medizinischen Standards und Schnittstellen (z.B. HL7) sind wünschenswert

Kenntnisse im medizinischen Kontext sind wünschenswert

Ausgeprägte Fähigkeit zum selbständigen, strukturierten und lösungsorientierten Arbeiten, Kommunikations- und Teamfähigkeit sowie Bereitschaft zur interdisziplinären Zusammenarbeit

Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Wir bieten Ihnen

Attraktive Vergütung und wohlverdiente Auszeiten

leistungsgerechte Vergütung je nach Aufgabenübertragung und Erfüllung der persönlichen Voraussetzungen bis zur Entgeltgruppe 13 unseres Haustarifvertrages

vermögenswirksame Leistungen und betriebliche Altersvorsorge (VBL)

30 Tage Erholungsurlaub

Alles für einen erfolgreichen Start

digitales Informationsportal für einen gelungenen Einstieg

eine flexible Einarbeitungsphase, die Ihnen ausreichend Zeit gibt, sich mit Ihren neuen Aufgaben vertraut zu machen

Entwicklungsmöglichkeiten nach Maß