Bioinformatiker/ Wissenschaftlicher Mitarbeiter Pathologie (m/w/d)

Bioinformatiker/ Wissenschaftlicher Mitarbeiter Pathologie (m/w/d)

Einleitung

Für das Institut für Pathologie am Standort Detmold suchen wir zum nächstmöglichen Termin eine/n

Wissenschaftlichen Mitarbeiter (m/w/d) Im Verbundprojekt CONFORM wird ein KI-gestütztes Handgerät auf Basis eines konfokalen Laserscanmikroskops (KLSM) zur intraoperativen Analyse von abdominalen Tumoren entwickelt.

Ziel ist es, Tumor- und gesundes Gewebe direkt während der Operation ohne Gewebeentnahme zuverlässig zu unterscheiden und Resektionsränder in Echtzeit zu bestimmen. Hierfür werden KLSM-Bilddaten erhoben, annotiert und zur Entwicklung einer KI genutzt, die anschließend in ein handgeführtes Gerät integriert und validiert wird.

Das System soll den Operationsablauf verbessern, die onkologische Sicherheit erhöhen und zusätzliche Eingriffe vermeiden.

Die Klinikum Lippe GmbH ist Teil des Universitätsklinikums Ostwestfalen-Lippe der Universität Bielefeld. Drei Standorte, rund 30 Kliniken und Kompetenzzentren, nahezu jede medizinische Fachrichtung. Als Haus der Maximalversorgung bietet das Klinikum Lippe Hochleistungsmedizin auf universitärem Niveau.

Ihre Aufgaben

Das ProjektIhre Aufgaben:

Verarbeitung und Organisation von Biomaterialien aus der Biobank

Erhebung sowie Auswertung von Datensätzen mittels ex-vivo konfokaler Laser-Scanning-Mikroskopie (KLSM)

Annotation, Aufbereitung und Qualitätssicherung von Bild- und Rohdaten zur Erstellung von Trainingsdatensätzen

Entwicklung und Evaluation von KI-Methoden zur Tumorerkennung

Konzeption, Aufbau und Pflege einer strukturierten Datenbank

Mitwirkung bei der Integration von KI in ein medizintechnisches System

Enge Zusammenarbeit mit klinischen und industriellen Projektpartnern

Unterstützung bei Validierung, Dokumentation sowie Berichten und Publikationen

Ihr Profil:

Abgeschlossenes Studium im Bereich Biomedizin, Bioinformatik, Medizin, Naturwissenschaften oder vergleichbar

Idealerweise erste praktische Erfahrung im Umgang mit Biomaterialien oder mikroskopischen Verfahren

Kenntnisse in Datenannotation, Datenmanagement oder Machine Learning von Vorteil

Sorgfältige, strukturierte und eigenverantwortliche Arbeitsweise

Teamgeist, Engagement und Interesse an interdisziplinärer Forschung

Wir bieten:

befristet für 2 Jahre, in Teilzeit (19,25 Stunden wöchentlich)

Mitarbeit in einem innovativen, interdisziplinären Forschungsprojekt an der Schnittstelle von Medizin, Technik und KI

Praxisnahe Einblicke in moderne Bildgebung und datengetriebene Analysen

Flexible Arbeitszeiten und eine gute Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben

Individuelle Weiterentwicklungsmöglichkeiten in einem zukunftsorientierten Forschungsfeld

Die Vergütung erfolgt nach EG 13 TVöD/VKA mit allen sonst üblichen Leistungen des öffentlichen Dienstes. Schwerbehinderte Bewerber werden bei gleicher Eignung und Befähigung bevorzugt berücksichtigt. Es besteht grundsätzlich die Möglichkeit der Teilzeitbeschäftigung.

Work & Family

Work-Life-Balance

Betriebliche Altersvorsorge

JobRad

Gesundheitsförderung

Fort- und Weiterbildung

Corporate Benefits

Kontakt

Sie haben Fragen? Für Auskünfte steht Ihnen Dr. med. Ulf Titze, unter gerne zur Verfügung.