Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (Promotionsstelle) – Infektionsimmunologie und T-Zell-Erschöpfung (m/w/d)

Das Institut für Molekulare Medizin und Zellforschung sucht eine*n

Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (Promotionsstelle) – Infektionsimmunologie und T-Zell-Erschöpfung (m/w/d)

Die Stelle dient der eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung durch Anfertigung einer Dissertation. Bearbeitet wird ein abgegrenztes Promotionsvorhaben zur Differenzierung, Funktion und Regulation erschöpfter T-Zellen in chronischen Infektionen, mit Schwerpunkt auf Antigenlast und TCR-Signalstärke / Progenitor- und Effektorsubpopulationen / transkriptionelle und epigenetische Programme / Reversibilität der Erschöpfung.

Aufgaben:

Bearbeitung des Promotionsvorhabens

Durchführung der Experimente des Promotionsvorhabens nach Abstimmung mit der Betreuung; zunehmend eigenständige Planung im Verlauf der Qualifizierung

zelluläre und molekulare Immunologie: Isolierung und Kultur primärer T-Zellen, adoptive Transfermodelle mit TCR-transgenen Zellen, Tetramer- und Multimerfärbungen, funktionelle Assays (Zytokinproduktion, Zytotoxizität, Proliferation, Restimulation)

Multiparameter- bzw. Spektralzytometrie einschließlich Panel-Design, Kontrollen und Zellsortierung

molekularbiologische Arbeiten: Klonierung, retro- oder lentivirale Transduktion primärer T-Zellen, CRISPR/Cas-basierte Editierung, qPCR, Proteinanalytik

Probenvorbereitung für hochdimensionale Analysen (Einzelzell-Transkriptom- und TCR-Repertoire-Sequenzierung, Chromatin-Zugänglichkeitsanalysen) einschließlich Qualitätskontrolle

Einarbeitung in neue Methoden und deren protokollgetreue Umsetzung; Erkennen und Melden von methodischen Problemen

Tierexperimentelle Arbeiten und Infektionsmodelle

Durchführung der tierexperimentellen Arbeiten im Rahmen genehmigter Versuchsvorhaben und ausschließlich im Umfang der nachgewiesenen eigenen Sachkunde nach § 16 TierSchVersV; bis zu deren Nachweis nur unter Anwesenheit und Aufsicht einer qualifizierten Person

Arbeit mit Modellen akuter und chronischer Infektion ([z. B. LCMV Armstrong und Klon 13, Listeria monocytogenes, VSV, Influenza, Tumormodelle]) einschließlich Infektion, Titerbestimmung und Verlaufskontrolle

Belastungsbeurteilung anhand der festgelegten Score Sheets, strikte Einhaltung der Abbruchkriterien, unverzügliche Meldung von Auffälligkeiten an Versuchsleitung und Tierschutzbeauftragte

Organ- und Probenentnahme, Aufbereitung und Weitergabe an die Analytik

fachliche Zuarbeit zu Versuchsanträgen sowie Führung der vorgeschriebenen Aufzeichnungen zu den durchgeführten Versuchen

Auswertung, Dokumentation und Publikation

Auswertung und statistische Analyse der eigenen Daten, einschließlich der Analyse hochdimensionaler Datensätze mit [R und/oder Python, FlowJo/OMIQ]

lückenlose Führung des Laborbuchs bzw. der elektronischen Dokumentation und Sicherung der Rohdaten nach den Vorgaben der Einrichtung

Literaturrecherche und Einordnung der eigenen Ergebnisse in den Forschungsstand

Mitwirkung an Manuskripten mit dem Ziel einer Erstautorenschaft; Erstellung von Abbildungen und Methodenteilen

Präsentation der Ergebnisse in Gruppenseminaren, Journal Clubs und auf Fachtagungen

Wissenschaftliche Qualifizierung

Anfertigung der Dissertation nach der geltenden Promotionsordnung

Teilnahme am Promotionsprogramm bzw. an der Graduiertenschule einschließlich der vorgesehenen Pflichtveranstaltungen und Berichte

regelmäßige Treffen mit der Betreuung und dem Thesis Advisory Committee; Erstellung der Fortschrittsberichte

Erwerb der versuchstierkundlichen Sachkunde nach § 16 TierSchVersV