Data Manager/-in (w/m/d) für Digitale Pathologie

besetzen wir eine Stelle als

Data Manager/-in (w/m/d) für Digitale Pathologie

Einsatzort: Institut für Pathologie -AG Nephropathologie/ Boor-

Arbeitszeit: 100% der vollen tariflich vereinbarten Arbeitszeit (zzt. 38,5 Std./Woche)

Befristung: zunächst unter Berücksichtigung des WissZeitVG für 1 Jahr, mit Option auf Verlängerung und Promotion

Einstieg: zum nächstmöglichen Zeitpunkt

Vergütung: EG 13 (TV-L)

Wir sind ein interdisziplinäres und internationales Team aus Wissenschaftlerinnen/Wissenschaftlern und Ärztinnen/Ärzten, das am Institut für Pathologie angesiedelt ist. Unser Team verfügt über langjährige Erfahrung in der Entwicklung neuer Methoden in den Bereichen digitale Pathologie, Bildanalyse und Deep Learning, einschließlich eines neuartigen Omics Ansatzes – der Next Generation Morphometry (Pathomics). Außerdem legen wir großen Wert auf energieeffiziente und nachhaltige KI ('green AI'), sowie auf sichere und erklärbare KI.

Unsere Hardwareausstattung umfasst eine leistungsstarke Recheninfrastruktur mit mehreren GPU-Clustern (NVIDIA DGX A100), CPU-Clustern und Datenservern. Zudem verfügen wir über eine einzigartige und kontinuierlich wachsende Sammlung sowohl präklinischer Datensätze als auch großer internationaler, multizentrischer Datensätze von Patientinnen und Patienten.

Ihre Aufgaben

Entwicklung und Management multizentrischer, internationaler Pathologie-Bilddatensätze inklusive weiterer Datenmodalitäten (Omics) und klinischer Daten

Sicherstellung der Datenqualität und Dokumentation gemäß den FAIR-Prinzipien

Gewährleistung der rechtlichen und regulatorischen Konformität

Kuratierung von Datensätzen zur Unterstützung von Forschenden, einschließlich Vorverarbeitung und Qualitätsprüfung von Bilddaten

Zusammenarbeit mit IT-Services und KI-Wissenschaftler/-innen bei der Administration der Hardware (Datenserver, GPU-Cluster)

Entwicklung neuer Ansätze zur Verwaltung von Pathologiedaten

Integration der Daten in eine entstehende nationale Forschungsinfrastruktur für Pathologiedaten

Ihr Profil

Zur Unterstützung unserer Forschung in der Digitalen Pathologie suchen wir eine Data Managerin/einen Data Manager: Eine hochmotivierte und zuverlässige Person mit technischen und organisatorischen Fähigkeiten. Die Aufgaben umfassen die Verwaltung und Kuratierung von Bilddatensätzen (mit zugehörigen klinischen und molekularen Daten) aus der biomedizinischen KI-Forschung, sowie die Anwendung und Anpassung von Methoden zur Auswertung der hochaufgelösten Bilddaten.

Abgeschlossenes Hochschulstudium (Master, Promotion oder gleichwertig) in Informatik, Data Science, biomedizinischer Informatik, Datenmanagement, Ingenieurwissenschaften oder einem verwandten Fachgebiet

Erfahrung im Forschungsdatenmanagement, vorzugsweise im Umgang mit klinischen Daten

Erfahrung mit Linux, Dateisystemen und Datenbanken

Kenntnisse im Bereich Datenschutz und Good Clinical Practice (GCP)

Wünschenswert:

Erfahrung in der Systemadministration

Programmierkenntnisse

Erfahrung in der Bildverarbeitung

Ausgezeichnete Kommunikations- und Teamfähigkeiten, insbesondere in der Zusammenarbeit mit einem interdisziplinären Team aus Ingenieurinnen/Ingenieuren, IT-Spezialistinnen/IT-Spezialisten, Biologinnen/Biologen und Klinikerinnen/Klinikern

Sehr gute Englischkenntnisse (Niveau C2 oder höher)

Eine zuverlässige und strukturierte Arbeitsweise

Begeisterung für biomedizinische Forschung

Wir bieten…

30 Tage Urlaub/Jahr

Mitarbeitende werben Mitarbeitende für verschiedene Berufsgruppen / Prämie von 3.